De dienst Federale Accountant werd opgericht in mei 2007. FEDCOM ging van start op 7 september 2007.

In september 2007 werd de piloot van het FEDCOM project gelanceerd. De gebruikers van de pilootfase konden vanaf 1 januari 2009 binnen de toepassing werken. Vanaf dit moment heeft de dienst Federale Accountant geleidelijk zijn rol als ondersteunende dienst binnen het kader van FEDCOM ontwikkeld. De andere bij het project betrokken organisaties zijn gefaseerd gestart.

• Pilootfase (september 2007 – februari 2009)
  - FOD Volksgezondheid, Veiligheid van de Voedselketen en Leefmilieu
  - De 4 horizontale FOD's (Kanselarij, Fedict, FOD Personeel en Organisatie, FOD Budget en Beheerscontrole)
  - De Administratie van de Thesaurie (voor de betalingen)
• Roll-out 1 (maart 2009 - februari 2010)
  - FOD Economie, KMO, Middenstand en Energie
  - FOD Werkgelegenheid, Arbeid en Sociaal Overleg
  - FOD Sociale Zekerheid
  - POD Maatschappelijke Integratie, Armoedebestrijding, Sociale Economie en Grootstedenbeleid
• Roll-out 2 (maart 2010 - februari 2011):
  - FOD Buitenlandse Zaken, Buitenlandse Handel en Ontwikkelingssamenwerking
  - FOD Financiën
  - FOD Mobiliteit en vervoer
• Roll-out 3 (maart 2011 - februari 2012):
  - FOD Justitie
  - FOD Binnenlandse Zaken
  - Federale Politie
  - Ministerie van Landsverdediging
  - POD Wetenschapsbeleid

In 2013 zal de FOD Budget en Beheerscontrole in de mogelijkheid zijn om, op basis van de input van de FOD's, een jaarrekening voor de federale Staat neer te leggen bij het Parlement, die de volgende elementen bevat:

• de balans, opgesteld na het in overeenstemming brengen van de rekeningen met de gegevens uit de inventaris;
• de resultatenrekening, die het geheel aan kosten en inkomsten herneemt;
• de samenvattende rekening van de budgettaire operaties, conform aan de economische classificatie;
• de toelichting