Het FEDCOM project wordt afgesloten in februari 2012, wanneer de implementatie van de toepassing afgelopen is bij de FOD's Justitie en Binnenlandse Zaken, het Ministerie van Landsverdediging, de Federale Politie en de PÖD Wetenschapsbeleid. Vanaf dat moment, gebruikt quasi het geheel van de federale instellingen de FEDCOM toepassing. De nieuwe taken van de dienst Federale Accountant zullen dus zijn:

• De organisatie en de opvolging van de boekhouding en de rapportering. De dienst heeft de opdracht om officiele documenten te produceren op vlak van boekhoudkundige rapportering.
• De verfijning, optimalisatie en modernisatie van het systeem.
• Het updaten van de basisgegevens (leveranciers- en klantgegevens) binnen de toepassing.
• Voorzien in een performante helpdesk.
• Het uitwerken van uitvoeringsbesluiten en de omzetting hiervan in richtlijnen en procedures voor de departementen, en de FEDCOM toepassing zo van een reglementaire basis te voorzien.
• Het functioneren en het onderhoud van de interfaces en de nodige programmering blijven een uitdaging.
• De Rijkscomptabiliteit harmoniseren, in samenwerking met de Gewesten en Gemeenschappen, door een coördinerende rol te verzekeren binnen de Commissie Rijkscomptabiliteit.

De beslissing van de regering over het al dan niet creëren van een algemene toepassing voor de organisaties die onder de wet van 2003 vallen, maar tot nog toe buiten de scope van het FEDCOM project vallen, zal eveneens doorslaggevend zijn. Als de beslissing positief is, zal een nieuw project opgestart moeten worden, dat eveneens in verschillende fasen zal verlopen.